MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 90597

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009633	GCA	2	6	310288	310293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388114
5502	NC_009633	TAA	2	6	310356	310361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388114
5503	NC_009633	GAA	2	6	310377	310382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388114
5504	NC_009633	ACT	2	6	310422	310427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388114
5505	NC_009633	CAT	2	6	310429	310434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388114
5506	NC_009633	TGA	2	6	310443	310448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388114
5507	NC_009633	GATG	2	8	310452	310459	25 %	25 %	50 %	0 %	150388114
5508	NC_009633	TGT	2	6	310473	310478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150388114
5509	NC_009633	ATG	2	6	310495	310500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388114
5510	NC_009633	TC	3	6	310511	310516	0 %	50 %	0 %	50 %	150388114
5511	NC_009633	CTA	2	6	310568	310573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388114
5512	NC_009633	TTG	2	6	310595	310600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150388114
5513	NC_009633	CTGTC	2	10	310692	310701	0 %	40 %	20 %	40 %	150388114
5514	NC_009633	ATG	2	6	310715	310720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388114
5515	NC_009633	ATG	2	6	310773	310778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388115
5516	NC_009633	TGA	2	6	310847	310852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388115
5517	NC_009633	TTA	2	6	310954	310959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388115
5518	NC_009633	A	6	6	311052	311057	100 %	0 %	0 %	0 %	150388115
5519	NC_009633	A	7	7	311424	311430	100 %	0 %	0 %	0 %	150388116
5520	NC_009633	ATA	2	6	311446	311451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388116
5521	NC_009633	ATG	2	6	311519	311524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388116
5522	NC_009633	A	6	6	311600	311605	100 %	0 %	0 %	0 %	150388116
5523	NC_009633	GTC	2	6	311647	311652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150388116
5524	NC_009633	AAG	2	6	311822	311827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388116
5525	NC_009633	A	6	6	311879	311884	100 %	0 %	0 %	0 %	150388116
5526	NC_009633	TCA	2	6	311922	311927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388116
5527	NC_009633	AGG	2	6	311936	311941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150388116
5528	NC_009633	GAA	2	6	311977	311982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388116
5529	NC_009633	GAA	3	9	312049	312057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388116
5530	NC_009633	AT	3	6	312141	312146	50 %	50 %	0 %	0 %	150388116
5531	NC_009633	CTG	2	6	312164	312169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150388116
5532	NC_009633	A	6	6	312187	312192	100 %	0 %	0 %	0 %	150388116
5533	NC_009633	TAT	2	6	312267	312272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388116
5534	NC_009633	ACC	2	6	312285	312290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150388116
5535	NC_009633	TGTA	2	8	312327	312334	25 %	50 %	25 %	0 %	150388116
5536	NC_009633	GGT	2	6	312348	312353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150388117
5537	NC_009633	TTA	2	6	312371	312376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388117
5538	NC_009633	AGG	2	6	312446	312451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150388117
5539	NC_009633	TGG	2	6	312508	312513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150388117
5540	NC_009633	GTT	2	6	312603	312608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150388117
5541	NC_009633	A	7	7	312616	312622	100 %	0 %	0 %	0 %	150388117
5542	NC_009633	AGG	2	6	312652	312657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150388117
5543	NC_009633	TAC	2	6	312881	312886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388118
5544	NC_009633	TA	3	6	312903	312908	50 %	50 %	0 %	0 %	150388118
5545	NC_009633	GTT	2	6	312935	312940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150388118
5546	NC_009633	AGA	2	6	312947	312952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388118
5547	NC_009633	GTA	2	6	312960	312965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388118
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5549	NC_009633	GAA	2	6	313015	313020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388119
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5551	NC_009633	ATG	2	6	313086	313091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388119
5552	NC_009633	TGC	2	6	313138	313143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150388119
5553	NC_009633	GAA	2	6	313294	313299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388120
5554	NC_009633	TGA	3	9	313320	313328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388120
5555	NC_009633	TGC	2	6	313333	313338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150388120
5556	NC_009633	TTA	2	6	313439	313444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388120
5557	NC_009633	T	6	6	313470	313475	0 %	100 %	0 %	0 %	150388120
5558	NC_009633	GTAT	2	8	313485	313492	25 %	50 %	25 %	0 %	150388120
5559	NC_009633	TGA	2	6	313734	313739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388120
5560	NC_009633	TCA	2	6	313770	313775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388120
5561	NC_009633	GAT	3	9	313826	313834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388120
5562	NC_009633	TCCTG	2	10	313867	313876	0 %	40 %	20 %	40 %	150388120
5563	NC_009633	TGAAA	2	10	313906	313915	60 %	20 %	20 %	0 %	150388120
5564	NC_009633	ATT	2	6	313931	313936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388120
5565	NC_009633	GGA	2	6	313978	313983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150388120
5566	NC_009633	GTA	2	6	313986	313991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388120
5567	NC_009633	TAGG	2	8	314091	314098	25 %	25 %	50 %	0 %	150388120
5568	NC_009633	GAG	2	6	314120	314125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150388120
5569	NC_009633	TGGAGG	2	12	314164	314175	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	150388120
5570	NC_009633	CAGA	2	8	314197	314204	50 %	0 %	25 %	25 %	150388120
5571	NC_009633	AAG	2	6	314222	314227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388120
5572	NC_009633	AAT	2	6	314252	314257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388120
5573	NC_009633	GAA	2	6	314283	314288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388120
5574	NC_009633	GCG	2	6	314390	314395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150388120
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5576	NC_009633	CCA	2	6	314559	314564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150388120
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5579	NC_009633	GGT	2	6	314905	314910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150388120
5580	NC_009633	GATG	2	8	314950	314957	25 %	25 %	50 %	0 %	150388120
5581	NC_009633	AAG	2	6	314958	314963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388120
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5585	NC_009633	AG	3	6	315125	315130	50 %	0 %	50 %	0 %	150388120
5586	NC_009633	GA	3	6	315138	315143	50 %	0 %	50 %	0 %	150388120
5587	NC_009633	GTT	2	6	315574	315579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150388121
5588	NC_009633	CCTG	2	8	315679	315686	0 %	25 %	25 %	50 %	150388121
5589	NC_009633	AGC	2	6	315712	315717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388121
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5593	NC_009633	ATT	2	6	316667	316672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388122
5594	NC_009633	TAT	2	6	317118	317123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388123
5595	NC_009633	TATTGA	2	12	317138	317149	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150388123
5596	NC_009633	TGATAC	2	12	317150	317161	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150388123
5597	NC_009633	TAG	2	6	317183	317188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388123
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5600	NC_009633	TAA	2	6	317364	317369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388123
5601	NC_009633	AG	3	6	317374	317379	50 %	0 %	50 %	0 %	150388123
5602	NC_009633	ATT	3	9	317380	317388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388123
5603	NC_009633	A	7	7	317389	317395	100 %	0 %	0 %	0 %	150388123
5604	NC_009633	A	6	6	317482	317487	100 %	0 %	0 %	0 %	150388123
5605	NC_009633	ATA	2	6	317515	317520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388123
5606	NC_009633	A	6	6	317520	317525	100 %	0 %	0 %	0 %	150388123
5607	NC_009633	AAG	2	6	317556	317561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388123
5608	NC_009633	TGTATA	2	12	317568	317579	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150388123
5609	NC_009633	A	6	6	317661	317666	100 %	0 %	0 %	0 %	150388124
5610	NC_009633	ACA	2	6	317694	317699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388124
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5612	NC_009633	AGA	2	6	317738	317743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388124
5613	NC_009633	AAG	2	6	317902	317907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388124
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5616	NC_009633	A	7	7	318102	318108	100 %	0 %	0 %	0 %	150388124
5617	NC_009633	AGG	2	6	318115	318120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150388124
5618	NC_009633	CAAG	2	8	318201	318208	50 %	0 %	25 %	25 %	150388124
5619	NC_009633	GCA	2	6	318222	318227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388124
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5988	NC_009633	AGA	2	6	338128	338133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388140
5989	NC_009633	AGC	2	6	338146	338151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388140
5990	NC_009633	CTG	2	6	338211	338216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150388140
5991	NC_009633	AT	3	6	338221	338226	50 %	50 %	0 %	0 %	150388140
5992	NC_009633	TCA	2	6	338304	338309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388140
5993	NC_009633	GGAGAA	2	12	338324	338335	50 %	0 %	50 %	0 %	150388140
5994	NC_009633	GCA	3	9	338360	338368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388140
5995	NC_009633	AAC	2	6	338494	338499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388140
5996	NC_009633	GACATT	2	12	338549	338560	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150388140
5997	NC_009633	CAA	2	6	338580	338585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388140
5998	NC_009633	CT	3	6	338762	338767	0 %	50 %	0 %	50 %	150388141
5999	NC_009633	AGA	2	6	338777	338782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388141
6000	NC_009633	AGA	2	6	338870	338875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388141

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